中医学理论体系的主要特点是整体观念和辨证论治。整体观念强调人体自身的完整性和人与自然、社会环境的统一性；辨证论治是中医认识疾病和治疗疾病的基本原则，是中医学对疾病的一种特殊的研究和处理方法。天人相应是整体观念的内容之一；形神一体也是整体观念的体现；三因制宜是辨证论治过程中遵循的原则；治病求本是中医治疗疾病的根本原则。所以除了整体观念外，中医学理论体系的主要特点是辨证论治，选A。