幽门螺杆菌（Hp）感染是消化性溃疡的重要致病因素之一，根除幽门螺杆菌可促进溃疡愈合、降低溃疡复发率，所以应用抗菌药物的主要目的就是抗幽门螺杆菌，而不是保护胃黏膜（有专门的胃黏膜保护剂来实现此功能）、抑制胃酸分泌（有质子泵抑制剂、H2受体拮抗剂等用于此）、清除肠道寄生菌（与消化性溃疡治疗关联不大）、增加胃动力（用于改善胃肠蠕动相关问题）。