牙周病不是正畸的禁忌证，但对罹患牙周病的患者正畸治疗的前提是：牙周病患者牙槽骨吸收不超过1/2，且必须在牙周病静止期，牙周炎症得到控制的条件下才能进行。因此必须与牙周病专科医师配合治疗。考虑到龈下刮治术后牙周病损的完全恢复需要一段过程，故对中、重度的牙周炎患者，一般应观察至牙周治疗4~6个月后再酌情进行正畸治疗。
但对于有下列牙周严重损害表现的患者：
①Ⅲ度松动牙；
②牙周破坏累及根尖1/3或根分叉暴露；
③牙根唇或舌面牙槽骨薄弱，则不应进行正畸治疗。