CD4和CD8分子分别与MHCⅡ类和Ⅰ类分子的结合，可增强T细胞与抗原提呈细胞或靶细胞之间的相互作用并辅助TCR识别抗原。MHC分子接纳抗原肽的结构，是位于该分子远膜端的抗原结合槽。Ⅰ类分子凹槽由α1和α2两个区形成，两端封闭、接纳的抗原肽长度有限，为8～10个氨基酸残基；Ⅱ类分子凹槽由α1和β1两个区形成，两端开放，进入槽内的抗原肽长度可为13～17个甚至更多的氨基酸残基。