Southern印迹杂交法把电泳分离和杂交结合起来，能检测出特异的DNA片段，而且能进行定位和测定分子量。Northern印迹杂交法可用于细胞中总RNA或mRNA的定性或定量。斑点杂交用于基因组中特定基因及其表达的定性与定量，但不能鉴定所测基因的分子量。菌落杂交法是将平板上要筛选的重组子或噬菌体转移到膜上经处理后进行杂交，用于基因工程研究中重组子的筛选。原位杂交用于核酸顺序在细胞水平的定位与测定。