职能制结构的不足包括：①多头领导，政出多门，不利于集中领导和统一指挥，造成管理混乱，令下属无所适从；②直线人员和职能部门责权不清，彼此之间易产生意见分歧，互相争名夺利，争功诿过，难以协调，最终必然导致功过不明，赏罚不公，责、权、利不能很好地统一起来；③机构复杂，增加管理费用，加重企业负担；④由于过分强调按职能进行专业分工，各职能人员的知识面和经验较狭窄，不利于培养全面型的管理人才；⑤这种组织形式决策慢，不够灵活，难以适应环境的变化。E项，组织内部缺乏横向交流是直线制.结构的缺点。