许多麻醉方法可以安全地用于接受造血干细胞移植的儿童及成人。没有哪一种药物、麻醉剂或者方法是绝对禁忌。笑气会移植蛋氨酸合酶的活性，其他的麻醉剂也会有骨髓抑制，但这些麻醉剂用于麻醉管理却并非禁忌。骨髓移植患者麻醉管理的特别之处在于，当患者中性粒细胞减少时，患者口腔黏膜炎的发生率及潜在发病率非常高。当需要行气管插管时，由于患者疼痛剧烈，术前的气道评估可能非常困难。同样的原因，清醒插管几乎是不可能的。气管插管时，患者的活动、挣扎都会引起出血、水肿，导致后入口处视野模糊。因此，需要行快速序贯性诱导时以尽量缩短气道缺乏保护的时间。