克罗恩病和溃疡性结肠炎统称为炎症性肠病，克罗恩病会累及全消化道，从食管到结肠均有可能受累，而溃疡性结肠炎仅累及结肠，不累及上消化道和小肠，胃肠道的壁有四层结构，；克罗恩病会累及肠道的全层，所以容易出现穿孔和狭窄，而溃疡性结肠炎通常仅累及肠道的浅层，一般不超过第二层，第三层。克罗恩病是种节段性的溃疡糜烂，而溃疡性结肠炎是连续性的病变。