HLA-Ⅰ类分子由α链和β-m链组成，分布在所有有核细胞的表面，由HLAA、B、C等基因编码，识别和提呈内源性抗原肽，与辅助受体CD8分子结合，对CTL的识别起限制作用。HLA-Ⅱ类分子由α链和β链组成，仅表达于淋巴组织中的某些细胞表面，由HLA-Ⅱ类基因DP、DQ、DR编码，识别和提呈外源性抗原肽，与辅助受体CD4分子结合，对Th的识别起限制作用。