自来水氟化3年后防龋效果不明显的原因主要是自来水中氟化物的浓度偏低（偏高则会产生氟牙症问题），应加强监测与调控力度，保持适宜的防龋浓度，因此E正确。由于有摄氟过量的问题，一个人不能同时接受两种或两种以上全身用氟措施，这样会有摄氟过量的问题，因此B错误。所以本题应选E。