妊娠3-5周，中枢神经系统、心脏、肠、骨骼及肌肉等均处于分化期，致畸药物在此期间可影响上述器官或系统；如沙利度胺可引起胎儿肢体、耳、内脏畸形，雌激素、孕激素、雄激素可引起胎儿性发育异常，叶酸拮抗剂可导致颅面部畸形、腭裂等；烷化剂如氮芥类药物可引起泌尿生殖系统异常，指（趾）畸形。