结核分枝杆菌难以被完全杀灭，其细胞壁富含脂质，药物难以通过；结核菌侵入人体后具有滞留性、潜伏性、冬眠性及突变性等特点，使结核病在病程上易迁延不愈，往往需要较长程的联合化疗，否则易于复发，甚至发展为耐药结核病、耐多药结核病，乃至严重耐多药结核病，成为难治性结核病。故结核病化学治疗成功的关键措施避免与克服细菌耐药。