上呼吸道感染可波及邻近器官，或向下蔓延，可引起中耳炎、鼻窦炎、颈淋巴结炎、气管炎、肺炎等，年长儿患链球菌性上呼吸道感染可引起急性肾炎、风湿热等。手足口病是一种柯萨奇病毒感染，在口腔内可见小疱疹或溃疡，手足部可见斑丘疹或疱疹，不属于上呼吸道感染并发症。