流行性腮腺炎的病原体检测方法有血清学检查和病毒分离。血清学抗体检测应用特异性抗体或单克隆抗体来检测腮腺炎病毒抗原，可作早期诊断；血清学抗原检测应用PCR技术检测腮腺炎病毒RNA，可明显提高可疑患者诊断率。病毒分离应用早期患者的唾液、血液、尿或脑膜炎患者的脑脊液，接种于原代猴肾等细胞，可分离出腮腺炎病毒。腮腺炎病毒分离接种不会采用胃液。