(来学网)某企业2019年企业所得税年度纳税申报的应纳税所得额为-120万元（假定以前年度均盈利并缴纳企业所得税）。2020年6月税务机关对该企业的2019年度纳税情况进行税务稽查发现如下问题：
（1）2019年6月企业以上年工资总额的10%为标准为全体职工支付补充养老保险，合计24万元，计入“管理费用”，12月进行账务调整，将超过当年职工工资总额的5%部分12万元调整计入“应付职工薪酬一应付职工福利费”。因当年实际发生的职工福利费用未超过规定标准，2019年企业所得税年度纳税申报时未作纳税调整；企业为职工支付的这部分补充养老保险未扣缴个人所得税（经计算为3万元）。
（2）2017年已作为“坏账损失”税前扣除的应收账款30万元，于2019年8月重新收回，企业将收到款项计入“其他应付款”科目，2019年企业所得税年度纳税申报时未作任何调整。
（3）2019年7月，因违约拒收供货方提供的预订货物，向供货方支付违约金4万元，企业计入“营业外支出”，2019年企业所得税年度纳税申报时未作纳税调整增加。
针对上述问题，税务稽查部门作出如下决定，并制作《税务行政处罚告知书》通知该企业：
（1）调增该企业2019年度企业所得税应纳税所得额46万元，分别为：超过当年职工工资总额5%的补充养老保险部分即12万元不允许在企业所得税税前扣除、以前年度已作资产损失当年收回的30万元应计入应纳税所得额、支付供货方违约金4万元不允许税前扣除。同时作出补税罚款和加收滞纳金的决定，对调增的所得额按适用税率应补缴企业所得税11.5万元，自2020年1月1日起按日加收万分之五的滞纳金和按应补税额处以0.5倍的罚款。
（2）对企业为职工支付的补充养老保险而未扣缴的个人所得税，责令该企业协助向纳税人追缴税款，并对该企业处以应扣未扣税款0.5倍罚款和自未扣缴税款申报期满之日起按日加收万分之五的滞纳金。
要求：请指出税务机关对该企业2019年企业所得税和未按规定扣缴个人所得税作出的补税、追缴税款、罚款和加收滞纳金的处理有哪些不当之处，并说明理由。