注册人违法使用不影响对商标侵权行为性质的认定。注册商标专用权是一种民事权利，商标注册人可以在法律允许的范围内行使其权利如果注册人在使用注册商标过程中存在违反《商标法》或《商标法实施条例》的情形，可以适用有关条款，要求行为人就违法使用行为承担相应的法律责任，但不影响对其注册商标专用权的保护，除非该注册商标被依法撤销。在注册商标专用权存续期间，他人擅自使用与该注册商标相同或近似的商标的，仍应认定为商标侵权行为。