菌群失调综合征最常见的发生原因是大剂量广谱抗生素持续较长时间的应用所致。致病菌多为艰难梭状芽孢杆菌和金黄色葡萄球菌，突出的临床表现为腹泻，排泄物呈蛋花样或海水样便。菌群失调综合征的治疗方法包括停用原用的广谱抗生素、更换对原发感染灶敏感的窄谱抗生素，同时加用抗真菌药物。但如果出现腹膜炎、疑有肠穿孔者应考虑行手术治疗，并使用抗真菌药。应用大剂量广谱抗生素控制感染与菌群失调综合征的治疗原则不符合。