原发性甲减是指由于甲状腺腺体本身的病变所引起的甲减。甲状腺手术、放射性碘治疗所致的甲状腺破坏、碘过量、抗甲状腺药物和自身免疫性甲状腺炎，均可引起原发性甲减；其中以自身免疫性甲状腺炎引起者最多，包括桥本甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎、产后甲状腺炎和亚急性淋巴细胞性甲状腺炎等。垂体疾病致TSH分泌减少所引起的甲减为继发性甲减；甲状腺激素在外周组织发挥作用缺陷所致甲减，为甲状腺激素抵抗综合征或甲状腺激素不敏感综合征；下丘脑疾病致TRH分泌减少引起的甲减为三发性甲减，均不属于原发性甲减的范畴。