肺炎链球菌是社区获得性肺炎最常见的病原菌，近年来其他病原也越来越多见，包括流感嗜血杆菌、卡他莫拉菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯杆菌、嗜肺军团菌、病毒、支原体、衣原体等，其中肺炎链球菌、嗜肺军团菌、肺炎衣原体、金黄色葡萄球菌等易致重症肺炎。嗜麦芽窄食单胞菌多发生于院内感染。