肢体末端慢性缺氧、代谢障碍中毒性损伤可导致杵状指，在肺部疾病中，杵状指最常见于肺部肿瘤和慢性脓毒性疾病(如支气管扩张症和肺脓肿)、肺内分流（如动静脉瘘)也可引起杵状指。伴有杵状指的肿瘤通常是恶性的。营养障碍性疾病中可见于肝硬化。杵状指也可能是是由于梅毒引起。杵状指为法洛四联症的典型症状。杵状指也可由特发性肺纤维化引起。