多潘立酮为促胃动力药，最佳服药时间在餐前30分钟。多潘立酮在胃肠道出血、机械性肠梗阻、胃肠穿孔、分泌催乳素的垂体肿瘤患者禁用。只有当功能性消化不良（FD）患者出现恶心和呕吐时，才建议使用多潘立酮进行治疗。另外，因其可引起Q-T间期延长，导致心律失常，因此不宜与酮康唑口服制剂、红霉素或其他可能延长Q-T间期的CYP3A4酶强抑制剂（如氟康唑、伏立康唑、克拉霉素、胺碘酮、泰利霉素等）联用。