(1)合格的支气管肺泡灌洗液应达到规定的回收比例，不可混有血液（红细胞数小于10%，不应混有过多的上皮细胞，一般为小于3%，不含气管和主支气管内分泌物。(2)利用纤维支气管镜进行防污染毛刷采样或支气管肺泡灌洗，将所取样本或灌洗液进行细菌定量培养及相关检查，可减少上呼吸道中的细菌污染，显著提高肺部感染病原学诊断的准确性。气管穿刺吸痰法，有一定的创伤性和危险性，不做常规应用。(3)BAL可致轻度并发症，包括灌洗时喘息、支气管痉挛，灌洗后寒战、发热，术后灌洗肺段短暂的肺泡浸润，肺功能可有暂时减低。感染性疾病可发生感染灶的播散。支气管肺泡灌洗术对有基础疾病者影响要比健康人更明显，并与操作者技术熟练程度有关。