mRNA主要功能是作为蛋白质合成的模板，占总RNA的2%～5%，5′末端是7-甲基鸟嘌呤结构，3′末端是多聚腺苷酸结构。mRNA主要分布于胞核和胞质，因此大多数真核生物的mRNA的5′末端是7-甲基鸟嘌呤结构（ABD三项），3′末端是多聚腺苷酸结构（C项）。