上牙槽后神经在翼腭窝内自上颌神经主干发出，经上颌结节后面发出上牙龈支至上颌磨牙颊侧的黏膜及牙龈，另有分支与上牙槽后动脉伴行进入上颌骨体后面的牙槽孔，经上颌窦后壁的牙槽管下行，分布于一侧上颌磨牙（除上颌第一磨牙近中颊根外）及其牙周膜、牙槽骨和上颌窦黏膜，并在上颌第一磨牙的近中颊根附近与上牙槽中神经相吻合。因该神经经翼腭窝发出，如果翼腭窝发生肿瘤的话会直接压迫上牙槽后神经。