通常人为地将平滑面菌斑分为3层，即菌斑牙界面（基底层）、中间层和菌斑表层。
①菌斑-牙界面：细菌位于获得性膜上方，细菌呈扇贝状排列于获得性膜表面。
②中间层：稠密微生物层，有球菌样微生物。
③菌斑表层：各种不同微生物构成呈丛状或丝状微生物，排列呈栅栏状。