深覆的病因包括遗传因素和环境因素。遗传因素如下颌支发育过长，下颌平面角较小，下颌呈逆时针旋转生长型，导致深覆。环境因素又包括先天因素和后天因素，后天因素包括：①全身因素使后牙牙槽高度过低、后牙萌出不足，导致下颌逆时针旋转，而前牙继续萌出，前牙槽高度发育过度；②功能因素即下颌功能性后缩使得下前牙脱离咬合而过度萌出，后牙区因较大的咬合力抑制了后牙牙槽的生长，使后牙牙槽高度过低，Spee曲线加深；③口腔不良习惯；④乳牙期及替牙期的局部障碍。