健康效应测量的内容主要包括疾病率的测量及生化和生理功能测量。其中疾病频率测量常包括：发病率、患病率、死亡率或各种疾病的专率，各种症状或功能异常的发生率，以及各种人群的专率（例如：年龄或性别专率、某职业人群某病专率）等；生化和生理功能测量有：按其手段的类型可分为生理、生化、血液学、免疫学、影像学、遗传学、分子生物学等的检测指标和方法；按人体器官系统包括呼吸系统、消化系统、神经系统、造血系统、生殖系统等的功能检测。