电镜下，不同类型的肾小球肾炎有着不同的病理改变。急性弥漫增生性肾小球肾炎以脏层上皮细胞和基底膜间出现驼峰样高密度沉积物为特点。膜性肾小球肾炎以上皮下电子致密物与基底膜样物质形成钉突样结构为特点。膜性增生性肾小球肾炎可表现为基底膜内皮侧、致密层或系膜区电子致密物沉积。系膜增生性肾炎以系膜区低密度电子致密物沉积为特点。