城建税按纳税人所在地的不同，设置了三档地区差别比例税率：市区7%，县城、镇5%，不在市区、县城或镇1%。现行教育费附加征收比率为3%，地方教育附加的征收比率为2%。该企业应补缴城市维护建设税和教育费附加、地方教育附加=（50000+20000+30000）×（5%+3%+2%）=10000（元）。故此题正确答案为D。