(1)根据《商标法》第六十条的规定，市场监督管理部门处理时，认定侵权行为成立的，责令立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品。根据《商标法》第六十二条的规定，县级以上市场监督管理部门根据已经取得的违法嫌疑证据或者举报，对涉嫌侵犯他人注册商标专用权的行为进行查处时，可以行使下列职权：①对当事人涉嫌从事侵犯他人注册商标专用权活动的场所实施现场检查；②检查与侵权活动有关的物品，对有证据证明是侵犯他人注册商标专用权的物品，可以查封或者扣押。市场监督管理部门有权检查与侵权活动有关的场所、物品，查封或扣押侵权物品，但不能查封D公司的工厂。2018年国务院机构改革，将国家工商行政管理总局的职责整合，组建国家市场监督管理总局，因此原相关法条中涉及的工商行政管理部门现应为市场监督管理部门。(2)即使B公司的注册商标是以不正当手段抢先注册他人在先使用并有一定影响的商标，也只有在先权利人可请求宣告该注册商标无效，D公司无权提起无效宣告，也不能以此抗辩（A错）。侵犯注册商标专用权不以知道为前提，D公司不知道B公司注册商标不能作为抗辩理由（B错）。D公司可以商标权人未使用注册商标进行抗辩（D对），如果B公司不能证明此前3年内实际使用过该注册商标，也不能证明因侵权行为受到其他损失的，被控侵权人不承担赔偿责任。D公司不能以生产侵权产品没有获利进行抗辩（C错），即使D公司没有获利，也应就其侵权行为向商标权人承担赔偿责任。(3)D公司在相同商品上使用与B公司注册商标近似的商标，属于仿冒注册商标行为。(4)即使B公司的注册商标是以不正当手段抢先注册他人在先使用并有一定影响的商标，也只有在先权利人可请求宣告该注册商标无效，E公司无权提起无效宣告，也不能以此抗辩。E公司可以商标权人未使用注册商标进行抗辩，如果B公司不能证明此前3年内实际使用过该注册商标，也不能证明因侵权行为受到其他损失的，被控侵权人不承担赔偿责任。E公司不知道其销售的“新紫其兰”裤子是侵犯注册商标专用权的商品，且能证明该商品是自己合法取得并说明提供者的，不承担赔偿责任。E公司不能以未获利进行抗辩。(5)A公司在B公司提出商标注册申请之前已使用“紫其兰”商标，且有一定影响，其“仍在继续生产‘紫其兰’牌裤子”，说明其对该商标的使用属于《商标法》第五十九条第三款规定的“在原使用范围内继续使用”，因此不侵犯B公司的注册商标专用权。C公司的销售行为因此也不侵犯B公司的注册商标专用权。“新紫其兰”与“紫其兰”商标近似，使用在相同或类似的商品上，可能引起混淆，因此D公司侵犯了B公司的注册商标专用权。E公司销售侵犯注册商标专用权的商品，也构成侵权。