计算过程为：
①应缴纳增值税为（4100-2000）÷（1+5%）×5%=100（万元）；
②土地增值税应税收入为4100-100=4000万元；
③可扣除房产原值为2000×（1+5%×10）=3000（万元）；
④扣除项目金额为3000+300=3300（万元）；
⑤该公司转让房产中获得的增值额为4000-3300=700（万元）；
⑥增值率为700÷3300=21.21%，确定税率为30%；⑦应纳土地增值税税额为700×30%=210（万元）。