细胞壁的主要功能是维持细菌固有的外形，并保护细菌抵抗低渗环境，起到屏障作用。如果没有细胞壁的保护，细菌在一般环境中会胀破。同时细胞壁与细胞膜一起参与菌体细胞内外物质交换。细胞壁上还带有多种抗原决定簇，决定细菌的抗原性。呼吸作用与细胞膜有关，与细胞壁无关。