医师开具处方应当使用经药品监督管理部门批准并公布的药品通用名称、新活性化合物的专利药品名称和复方制剂药品名称，A选项正确；医师开具院内制剂处方时应当使用经省级卫生行政部门审核、药品监督管理部门批准的名称，B选项正确；医疗机构应当按照经药品监督管理部门批准并公布的药品通用名称购进药品，C选项正确；医师可以使用由卫生部公布的药品习惯名称开具处方，E选项正确，D选项中“医师不可以使用由卫生部公布的药品习惯名称开具处方”说法错误。