肝素是一种酸性黏多糖，其抗凝的主要作用机制是与抗凝血酶Ⅲ结合，使抗凝血酶Ⅲ的构象发生改变，暴露出其活性中心，从而显著增强抗凝血酶Ⅲ对凝血因子的灭活作用，尤其是对凝血酶（Ⅱa）和因子Xa的抑制作用（E选项正确）。肝素对血小板的聚集有一定的抑制作用，但不是其主要抗凝机制（A选项错误）。肝素可以间接抑制凝血酶原的激活，但不是主要作用机制（B选项错误）。肝素对因子X的激活有抑制作用，但同样不是主要机制（C选项错误）。肝素促进纤维蛋白吸附凝血酶不是其主要抗凝作用机制（D选项错误）。