牙本质主要由牙本质小管、成牙本质细胞突起和矿化的细胞间质所组成，但牙本质的矿化不是均匀的，在不同区域因其矿化差异而有着特定的名称：①管周牙本质，围绕成牙本质细胞突起，呈环形的透明带，矿化程度高；②管间牙本质，位于管周牙本质之间，矿化较管周牙本质低；③球间牙本质，牙本质的钙化主要是球形钙化，在钙化不良时，钙质小球之间遗留些未被钙化的间质，称为球间牙本质；④生长线，表示牙本质有规律的发育和形成；⑤托姆斯颗粒层，牙根部牙本质透明层的内侧有一层颗粒状的未矿化区，称为托姆斯颗粒层；⑥前期牙本质，在成牙本质细胞和矿化牙本质之间总是有一层尚未矿化的牙本质存在，称为前期牙本质。在生理情况下，按牙本质形成时期的不同，可将其分为：①原发性牙本质，是指牙发育过程中所形成的牙本质，构成牙本质的主体，最先形成的紧靠釉质和牙骨质的一层原发性牙本质，胶原纤维的排列与小管平行，在冠部者称罩牙本质，在根部者称透明层，罩牙本质和透明层内侧的牙本质称髓周牙本质；②继发性牙本质，是指牙发育至根尖孔形成后，一生中仍持续不断形成的牙本质。牙本质的反应性变化包括：①修复性牙本质，是釉质表面因磨损、酸蚀、龋病等而遭受破坏时，部分成牙本质细胞继续形成的牙本质；②透明牙本质，是釉质表面因磨损、酸蚀、龋病等而遭受破坏时，成牙本质细胞突起变性，牙本质小管内矿物盐沉着而矿化封闭小管，使该区域光镜下呈透明状，称为透明牙本质；③死区，是釉质表面因磨损、酸蚀、龋病等而遭受破坏时，成牙本质细胞突起变性、分解，小管内充满空气，光镜下这部分牙本质呈黑色，称为死区。