选项A,企业之间支付的管理费、企业内营业机构之间支付的租金和特许权使用费，以及非银行企业内营业机构之间支付的利息，不得扣除。选项C企业计提的未经核定的准备金支出是不可以扣除的，因此企业计提的存货跌价准备不可以从收入总额中扣除。咨询费用可以据实扣除。选项D,国家机关的罚款不能从收入总额中扣除。