本题考查同一控制下企业合并取得长期股权投资初始投资成本的确定。同一控制下企业合并取得的长期股权投资初始投资成本=合并日被合并方所有者权益在最终控制方合并财务报表中的账面价值×持股比例=4 000×80%=3 200（万元），选项A当选；选项B不当选，误以甲公司发行股票的公允价值为基础计算长期股权投资初始投资成本；选项C不当选，误以乙公司所有者权益在最终控制方合并报表的公允价值的份额为基础计算长期股权投资初始投资成本；选项D不当选，误以乙公司自身所有者权益份额为基础计算长期股权投资初始投资成本。
甲公司应编制的会计分录为：
借：长期股权投资 3 200
  贷：股本 1 000
   资本公积——股本溢价 2 200