细菌性痢疾是由志贺菌属所引起，为革兰阴性细长杆菌，人类感染10个以上志贺菌即可引起痢疾，志贺菌抵抗力较弱，对各种消毒剂均很敏感，志贺菌的外毒素又称为志贺神经毒素，我国以福氏痢疾杆菌多见，其次是宋内志贺杆菌。目前分为A、B、E、D4群（分别相当于痢疾、福氏、鲍氏和宋内志贺菌）及40个血清型及各个亚型。