乙脑常出现病理反射阳性，浅反射消失，深反射先亢进后消失等。最常见的并发症是支气管肺炎，其次是肺不张、金黄色葡萄球菌败血症等。根据病程可分为初期、极期、恢复期、后遗症期。初期即有发热，高热是乙脑必有的表现，一般均为高热，高热往往可持续7～10天，重者甚至可达3周以上；极期的主要表现是高热、意识障碍、惊厥或抽搐、呼吸衰竭；本期的主要死因是呼吸衰竭；恢复期以及后遗症期都可有精神异常、瘫痪、失语等表现。