本题考查抵销、留置与同时履行抗辩权。选项A当选，选项B不当选，当事人互负债务，标的物种类、品质不相同的，经双方协商一致，也可以抵销，此为约定抵销。本题中，甲公司和乙公司互相负有的到期债务之内容并不相同，不符合法定抵销的条件，但仍然可以由双方当事人通过约定抵销。选项C当选，由于甲公司未支付修理费用（即未履行到期债务），乙公司可以就其占有的属于甲公司的运煤车行使留置权。选项D不当选，同时履行抗辩权的行使以同一双务合同法律关系为前提。题干中，煤炭买卖与运煤车修理分属不同法律关系，乙公司不得基于甲公司未支付修理费用的情况就交付煤炭的债务对甲公司行使同时履行抗辩权。