患者尿液检查有蛋白（++），提示存在蛋白尿，伴有红细胞、白细胞及颗粒管型，结合乏力、腰部疼痛、水肿等表现，考虑可能为肾炎等肾脏疾病。肾炎性水肿多从眼睑、颜面等组织疏松部位开始，晨起时较为明显，随后可逐渐蔓延至全身，所以最可能发现水肿的部位是眼睑和颜面，选择A选项。