乙酰 CoA 进入三羧酸循环彻底氧化分解，生成二氧化碳和水，并释放大量能量，这是其主要的代谢去路。在三羧酸循环中，乙酰 CoA 与草酰乙酸缩合生成柠檬酸，经过一系列反应后又重新生成草酰乙酸，同时产生 NADH、FADH₂等还原型辅酶，这些还原型辅酶通过氧化磷酸化过程生成大量 ATP，为细胞提供能量。